In Nextflow geschriebene Bibliotheken
rnaseq
RNA-Sequenzierungsanalyse-Pipeline mit STAR, RSEM, HISAT2 oder Salmon mit Gen-/Isoformenzählung und umfassender Qualitätskontrolle.
- 646
- MIT
sarek
Analysepipeline zur Erkennung von Keimbahn- oder somatischen Varianten (Vorverarbeitung, Variantenaufruf und Annotation) aus WGS/gezielter Sequenzierung.
- 256
- MIT
configs
Konfigurationsdateien, die zum Definieren spezifischer Parameter für Rechenumgebungen an verschiedenen Institutionen (von nf-core) verwendet werden.
- 71
- MIT